Мицуко Аояма появилась на свет 7 июля 1874 года в Токио. Её отец, Кихати Аояма, занимался торговлей маслами и антиквариатом, а мать, Цунэ, поддерживала семейный бизнес. Магазин семьи располагался в непосредственной близости от австрийской дипломатической миссии, что в дальнейшем сыграло ключевую роль в судьбе Мицуко.